Hast du den Dienst neugestartet gehabt? Davon abgesehen, ist es mit der Änderung nicht getan. Leider.^^
i-MSCP unterstützt ohne Plugins nicht mehr als eine php Umgebung und diese wird während der Installation bestimmt (bzw. nach- oder rekonfiguriert).
Wenn du mehrere Versionen brauchst, wird du um das Plugin "PHPSwitcher" nicht drum herum kommen.
So aktuell meine Information dazu, welche natürlich auch nicht ganz richtig sein kann.
Wenn es so klappt (ohne Probleme und co), kannst du nen listener file schreiben und diesen über i-MSCP direkt ausführen lassen.
So lasse ich nginx, apache2, proftp und co automatisch nach Änderungen anpassen. Da ich gewisse Dinge angepasst habe.